Διαφωνίες και κόντρες του Θεόκλητου, οι θέσεις που εξέφραζε
Ο Μητροπολίτης Ιωαννίνων εξέφραζε πάντα μια άλλη άποψη από τις γνωστές παραδοχές, είχε ταχθεί υπέρ της καύσης των νεκρών, της πολιτικής κηδείας, του χωρισμού εκκλησίας - κράτους, είχε κατηγορήσει όσους εμπορεύονται τα ιερά λείψανα των αγίων και θησαυρίζουν, προκαλώντας μεγάλες αντιδράσεις, οι κόντρες του με τον Χριστόδουλο αποτέλεσαν μέγα θέμα, ήταν ο μόνος που μίλησε για το σκάνδαλο του Βατοπεδίου, στη μεγάλη κόντρα του Πατριάρχη με τον Χριστόδουλο, είχε πάρει σαφή θέση υπέρ του Βαρθολομαίου.